Yayasan Pupuk Kaltim sejak berdirinya telah membuktikan bahwa selain unggul dalam bidang keilmuan umum, namun tidaklah kalah dalam bidang keagamaan. Banyak sekali prestasi bidang kegiatan keagamaan yang diraih oleh Yayasan Pupuk Kaltim. Guna memberikan layanan yang lebih besar lagi kepada masyarakat kota Bontang, maka Yayasan Pupuk Kaltim menjadi sekolah yang pertama kali menjadi sekolah umum yang religius. Dengan maksud bahwa Yayasan Pupuk Kaltim akan memberikan layanan keagamaan yang bagu bagi semua pemeluk agama, sehingga semua agama menjadi lebih paham di bidangnya masing-masing.